База данных структурных мотивов белков: биологические и физико-химические свойства

Описание

Набор данных создан с использованием технологий машинного обучения, нейронных сетей и содержит аннотации биологических и физико-химических свойств структурных мотивов белков. Аннотация включает параметры для: белка (название белка, название организма, код таксономической группы, биологический процесс и функция белка); структурного мотива белка (тип мотива, цепь в белке, локус и длина, аминокислотная последовательность, физико-химические свойства); эксперимента (источник структуры белка, разрешение структуры, экспериментальный метод и название эксперимента).

Набор данных предназначен для проведения структурного анализа белков, ассоциированных с развитием заболеваний, в том числе аберрантных форм белков, которые образованы вследствие аминокислотных замен, модифицирования после синтеза. Набор данных может применяться для решения прикладных медико-биологических задач, таких как разработка новых подходов к диагностике заболеваний, изучение молекулярных основ патогенеза, выявление мишеней белкового происхождения для лекарственных средств и проектирование миметиков (белков с заданными свойствами).

Набор данных содержит 3.96 млн аннотаций структурных мотивов в белковых структурах с указанием внутренних координат. Обновление версии набора данных выходит не реже одного раза в год. Набор доступен в формате CSV.